南通大学地理科学学院前身为南通教育学院地理科，成立于1984年，1986年～1993年，招收普通高校大专层次的地理科学专业学生。1994年～1999年，从事在职地理教师的培训。1999年5月随着南通师范专科学校与南通教育学院合并组建南通师范学院，更名为南通师范学院地理系，同年在全省范围内招收地理科学专业专科学生。2001年9月，开设本科地理科学专业，设置地理教育和城乡规划两个方向，当年共招收67名学生。2002年9月，招收“地理科学”和“资源环境与城乡规划管理”两个本科专业、一个地理信息系统方向学生。2004年5月，随着南通师范学院与南通工学院、南通医学院合并组建南通大学，成立地理科学学院。
南通大学地理科学学院现有教职工52名，其中专任教师42名。全日制本科在校学生787名。学院设有地理科学（师范）、地理信息系统、环境科学、资源环境与城乡规划管理、旅游管理五个本科专业，其中旅游管理专业与美国夏威夷太平洋大学签订了合作办学协议。
多年来的建设和发展，使南通大学地理科学学院形成了团结、严谨、务实的办学风格。学院非常重视教师队伍的建设，通过内部培养、外部引进，逐步形成了一支思想素质高、业务素质精、工作能力强、学历和职称结构比较合理的师资队伍。专任教师中教授1人、副教授7人；博士(含在读)22人，硕士以上学历人员占专任教师总数的92%。目前，教师主持国家自然科学基金项目5项，承担省（部）、市（厅）级和横向合作项目多项。学院注重通过“青蓝工程”、教师教学比赛等活动，提高教师的教学水平。通过举办“院士论坛”，定期邀请兼职教授、客座教授来院讲学和开展经常性的院内学术讲座等，拓宽了师生知识视野，提升了师生科研创新能力。适应社会的需要，十分注重学生应用技术和技能的训练，建有自然地理学、城市规划设计、环境学、地理信息系统、制图与遥感图像处理5个实验室和庐山国家地质公园等16个野外实践教学基地，强化了实验和实习环节，提高了学生的实践和操作能力。加强常规管理，开展多种活动，丰富学生的课余生活，学生工作有声有色。
近年来，由于专业设置合理，学生业务基础扎实、综合能力强，毕业生深受用人单位青睐，每年的毕业生就业率均为100％，被评为南通大学就业工作先进单位。
