（1）沙漠扩大：截止1994年底,沙漠面积达43.04万平方千米。自1949年以来,全区沙漠面积平均以84.2平方千米/年的速度增加,其扩大速度是人类历史时期沙漠扩大速度的2.44倍。
　　（2）水域缩小,湖泊萎缩：我区20世纪50年代湖泊面积约9700平方千米，20世纪70年代末锐减为4748平方千米，湖泊总面积减少51%。罗布泊、玛纳斯湖、艾丁湖、台特马湖等相继干涸。塔里木河河道缩短200千米以上，导致沙漠地区更加干旱，植被衰败。塔河下游干涸河床草场退化。
　　（3）草场退化：全区草场退化面积已达0.08亿公顷，全区可有效利用草场面积为0.22亿公顷，正常利用的草场面积为0.27亿公顷，仅占56%。自由放牧、超载过牧和人为活动对草场的滥垦、滥挖和鼠害对草原造成严重危害。