南京审计学院是我国审计高等教育发源地之一，为审而立、依审而兴、靠审而强。学校始建于1983年，1987年更为现名，2002年原南京金融高等专科学校并入，组建新的南京审计学院。 2007年学校以“优秀”等级通过教育部本科教学工作水平评估。2009年经国务院学位委员会批准，学校被列入新增硕士学位授权立项建设单位。2011年学校被国务院学位委员会批准成为全国首批审计硕士专业学位授权单位。2011年教育部、财政部、审计署和江苏省人民政府共建南京审计学院。
南京审计学院现有全日制普通本科在校生近15000名，研究生（含10名留学研究生）60名。专任教师881名，正高职称109名，博士（含在读）420名。拥有莫愁、浦口两个校区，占地近2200亩。
南京审计学院是一所以审计为品牌，经、管、法、文、理、工等学科相互支撑、协同发展的财经类院校。学校设有26个本科专业，其中，审计学、金融学、财政学为教育部特色专业建设点，财政学类、金融学类、管理科学与工程类、工商管理类、审计学为江苏省“十二五”重点专业，审计学、金融学为江苏省品牌专业，财政学、会计学、工商管理、国际经济与贸易、信息管理与信息系统为江苏省特色专业；审计学教学团队、金融学核心课程教学团队为江苏省高校优秀教学团队；金融学专业复合型应用性金融人才培养模式创新实验基地为江苏省高等教育人才培养模式创新实验基地。“审计高等教育理论探索与实践创新”获江苏省高等教育教学成果特等奖和国家级优秀教学成果二等奖。2012年，学校被评为“江苏省教学工作先进高校”。
审计科学与技术为江苏高校优势学科，理论经济学为江苏省一级重点培育学科，法学、公共管理为江苏省一级重点建设学科。“现代审计理论与方法”、“ 区域金融创新研究团队”和 “价值链分工的经济效应”为江苏省高校“青蓝工程”科技创新团队；现代审计发展研究中心和金融风险管理研究中心为江苏省高校哲学社会科学研究基地。近五年来，学校承担国家自然科学基金、社会科学基金项目42项，省部级科研项目115项。学校承担了“2014年国际奥林匹克青年运动会（南京）财务预算方案”、“中国广东核电集团台山核电有限公司内部审计质量评估”、“中国长江三峡集团公司信息系统管理与风险控制”等课题。学校在《经济研究》、《中国科学》等权威期刊发表论文150余篇，在中文社会科学引文索引（CSSCI）期刊发表论文1 060篇，出版著作47部，获省部级科研成果奖13项。学校主办的《审计与经济研究》期刊跻身CSSCI来源期刊和“全国高校百强社科期刊”行列。
学校积极推进国际化办学。五年来，赴海外一流大学访学、培训教师逾200人次；赴海外参加联合国审计的教师逾25人次；诺贝尔经济学奖获得者莱茵哈德•泽尔腾、美国审计长基恩•多达罗等668名境外专家学者来校或受聘荣誉教授或访问、讲学或开展学术交流；1248名学生赴境外高校或机构研修、交流，或参加国际会议、学科性竞赛、海外志愿者活动等；学校与最高审计机关国际组织（INTOSAI）、亚洲最高审计组织（ASOSAI）、国际内部审计师协会（IIA）等国际行业组织，美国、法国等十几个国家和地区的最高审计机关以及欧、美、澳、非等4大洲的高等学校建立了广泛的学术交流和合作关系。学校被IIA认证为中国唯一的全球内部审计教育伙伴（IAEP）“合作级”高校，与全球伙伴高校开展学生互换、教师互聘、学分互认、科研合作；被英国特许公认会计师公会（ACCA）评为“全球培养ACCA人才最多大学”、授权为“全球白金级培训机构”。
南京审计学院努力为每一个学生提供建设性的学习环境，引导学生形成有意义的高等教育经历。浦口新校区山水相间，树石相融，庄重典雅，清新自然，设施优良。学习支持、成才规划、心理咨询、助困助学促进学生健康成长。学校每年为学生提供上百次境外学习机会，鼓励每一个学生积极参加社团活动、志愿服务、社会实践。