根据文成公主的建议修建，现有面积约为21500平方米，仍是1000多年前的唐代建筑，殿内中心部分还保持原来式样。主殿觉拉康殿内主供文成公主从长安带来的释迦牟尼12岁时身量紫金像。二层配殿内，供有松赞干布、文成公主的塑像，殿堂及四周回廊间绘满壁画，其中《文成公主进藏图》、《大昭寺修建图》等，都如实反映了当初唐蕃和亲的历史画面。大昭寺的围墙内，还立着一块唐蕃舅甥会盟碑。碑立于唐长庆三年（公元823年）。蕃方先派专使来到长安，在西郊与唐政府官员举行会盟仪式。会盟之后，唐方又派专使入蕃，在逻些（拉萨）设盟坛。碑文追述唐蕃历史，强调了文成、金城嫁给吐蕃赞普的舅甥姻缘关系，记述了会盟经过，是汉藏人民友好关系的历史见证。西藏从元代起就正式成为我国行政区划的一部分。明王室与西藏的联系更密切，据礼部统计，15世纪60年代，西藏到北京朝贡的人最多时达三四千。明中央政府也多次派使团到西藏抚慰，带去很多珍贵礼物，大昭寺内至今还珍藏着两幅明代的唐卡（刺绣的卷轴画）。清代为加强对西藏的管理，又设驻藏大臣，负责全面督办西藏事务，并规定了达赖、班禅转世抽签的办法。乾隆五十七年（公元1792年），设立“金瓶掣［chè彻］签”制度。达赖、班禅及蒙藏大活佛的灵童转世，必须将所找到的灵童名字写在牙签上，放在瓶里，分别在北京雍和宫和西藏大昭寺，由理藩院尚书或驻藏大臣监督掣定，防止蒙藏贵族操纵大活佛转世。这些措施稳定了西藏社会秩序，密切了西藏与内地的联系。乾隆当年所赐的抽签的金本巴瓶今天仍藏在大昭寺内。大昭寺门前还有一块乾隆年立的《劝人种痘碑》，当时西藏天花流行，病人被赶到山野岩洞，任其死亡。清驻藏大臣和琳命人专门建房护理天花病人，使不少人痊愈生还。他还严谕前后藏，劝令班禅和达赖以后照此办理。事后刻石立碑，让藏人懂得痘疹并非不治之症的道理。